Juoksualusta vaikuttaa esimerkiksi vammautumisriskiin, juoksukenkien valintaan ja jopa harjoitusvaikutuksiin. Kaikissa pinnoitteissa on omat hyvät ja huonot puolensa.
Asfaltti
Asfaltti on tasainen ja kova alusta, joka ei juuri anna periksi juoksijan alla, joten kenkien iskunvaimennuksen on oltava kunnossa. Liika juokseminen asfaltilla saattaa aiheuttaa kipuja ja rasitusvammoja, joten pelkkää asfalttijuoksua ei suositella. Maratonharjoittelussa asfaltilla on juostava reilusti, jotta askel saadaan rullaamaan maratonalustan edellyttämällä tavalla.
Asvaltti pitää hyvin, mutta alusta on kova, tasainen ja monotoninen. Jalkojen lihaskunto ja koordinaatio eivät pääse kehittymään yhtä hyvin kuin epätasaisemmilla alustoilla.
Maasto
Maastossa juoksu on henkisesti virkistävää. Polkujuoksun ja suunnistuksen suosion kasvu on lisännyt maastojuoksun suosiota. Maaston jatkuva vaihtelu ja erilaiset alustat antavat hermostolle uusia ärsykkeitä. Maastossa jokainen askel on erilainen, mikä kehittää koordinaatiota. Lihasten, jänteiden ja sidekudosten elastisuus kasvaa, kun keho joutuu sopeutumaan vaihtelevaan maastoon. Metsäpolulla juokseminen on luonnollista, koska polun kunto määrää vauhdin. Joustava alusta tekee hyvää jaloille. Jatkuvat rytminvaihdokset kehittävät juoksutekniikkaa ja parantavat voimaominaisuuksia.
Hiekkatie
Hiekkatie on monien suosikkialusta juoksemiseen. Monet ulkoilureitit ja kuntopolut ovat myös hiekkapohjaisia. Hiekkatie on hyvä juosta, koska se on tarpeeksi kova, tasainen ja kimmoisa alusta kovavauhtiseen juoksuun. Hiekkatie antaa kuitenkin hieman periksi ja on siten jaloille armollisempi kuin asfaltti tai betoni.
Pururata
Suomi on pururatojen luvattu maa. Pururata on pehmeytensä puolesta monen suosikkialusta, mutta pehmeä puru voi olla nilkoille kohtalokas. Puru on parhaimmillaan lähellä ihanteellista juoksualustaa, mutta pahimmillaan se voi aiheuttaa rasitusvammoja. Pururadan joustavuus voi säästää niveliä iskuilta. Sopivan kova puru soveltuu erinomaisesti juoksemiseen, mutta usein kostea tai tuore puru on liian pehmeä alusta, jolloin jalkojen virheasennot korostuvat. Jos purua on paljon, muuttuu juokseminen todella raskaaksi. Pururadat on usein tehty varsin mäkiseen maastoon hiihtoa varten, minkä takia lenkeistä tulee helposti kuormittavia.
Urheilukenttä
Lenkin ohessa kannattaa piipahtaa juoksemaan kiihdytyksiä radalle tai nurmelle. Urheilukentällä voi myös tehdä erilaisia lihaskunto- ja tekniikkaharjoituksia ja vetotreenejä. Pitkien lenkkien juoksemista säännöllisesti urheilukentällä ei suositella. Useimmiten ratoja käytetään vain vauhdikkaampiin harjoituksiin ja sellaisiin treeneihin, joissa vaaditaan tarkkaa mitattavuutta. Keinopäällysteiset radat voivat olla joko liian kimmoisia tai liian kovia.
Ruoho
Tasainen ruohikko on miellyttävä alusta juosta, mutta se voi olla myös petollinen. Pehmeä ja joustava alusta säästää jalkoja iskuilta, mutta usein nurmikot ovat epätasaisia, jonka takia jalkoihin kohdistuu ylimääräistä rasitusta.
Lumi
Lumi sopii myös juoksijan alustaksi. Nastoitettu lenkkikenkä takaa pidon liukkaammallakin kelillä. Kylmällä, liukkaalla tai muuten huonolla kelillä juoksumatolla voi tehdä samoja harjoituksia kuin ulkonakin.
Vesi
Myös vedessä voi juosta. Vesijuoksu tarjoaa pehmeän ja kevyemmän vaihtoehdon juoksemiselle.